Nakon proglašenja Crne Gore Ekološkom Državom 1991 godine, usvajanjem Deklaracije sa Samita u Rio ge Janeiru 1992 godine o održivom razvoju i definisanjem Politike zaštite životne sredine Crne Gore u Zakonu o životnoj sredini(1996), iskristalisala se potreba uspostavljanja monitoringa kvaliteta svih segmenata životne sredine u skladu sa međunarodnim standardima. S tim u vezi Ministarstvo zaštite životne sredine izradilo je, sagledavajući postojeće institucionalne kapacitete u Crnoj Gori, Elaborat o osnivanju JU Centra za ekotoksikološka ispitivanja Crne Gore (u daljem tekstu CETI) kao referentne institucije za kontrolu kvaliteta životne sredine i kontrolu hrane i drugih proizvoda i dijagnostiku toksikanata.
Javna ustanova Centar za ekotoksikološka ispitivanja je osnovana Odlukom Vlade Republike Crne Gore od 20.12.1996. godine (Sl.list br. 40/96) . U skladu sa Zakonom o privrednim društvima CETI je, 2012. godine, transformisan Odlukom Vlade u D.O.O, u 100% vlasništvu Vlade Crne Gore (Sl. List br. 39/12 ).
CETI je od 1998 godine, kada je i zvanično počeo sa radom, dobio sve neophodne sertifikate i ovlašćenja za rad u skladu sa važećim zakonskim propisima. CETI je od 2004. godine akreditovan po ISO/ IEC 17025 standardu od strane JUAT-a i pre-akreditovan od SWEDAC-a i postao prva Akreditovana Laboratorija u Crnoj Gori za oblast ispitivanja svih parametara kvaliteta pijaćih, površinskih, podzemnih i otpadnih voda i leda, teških metala i zdravstvene ispravnosti riba, analize sedimenata, zemljišta i ispitivanje radioaktivnosti životne sredine i životnih namirnica. Shvatajući neophodnost kontinualnog dokazivanja kompetentnosti u svim djelatnostima zbog kojih je osnovan prilikom resertifikacije od strane Crnogorskog Akreditacionog tijela 2008.i kontrolne provjere 2010 godine CETI je svoj obim akreditacije značajno proširio (vazduh, buka, hrana animalnog i biljnog porijekla).
